물리학과는 전자 · 우주 · 사이버전이 교차하는 다영역 작전 환경을 주도할 국방 과학기술의 원리를 탐구한다. 현대 무기의 근간인핵과 우주 분야는 물론, 미래전의 판도를 바꿀 레이저와 양자 기술 등 첨단 국방 과학의 물리적 기저를 깊이 있게 다룬다.
이러한 물리학적 통찰은 전장의 복잡한 변수를 분석하고 첨단 전력을 완벽히 통제하기 위한 현대전의 필수 소양이다. 생도는 기술적 우위를 작전의 승리로 직결시키는 과학적 지휘 역량을 배양하며, 융합적 사고와 창의적 문제 해결 능력을 겸비한다.
최종적으로 물리학과는 첨단 기술로 무장한 과학화 강군을 현장에서 선도할 미래 육군의 최정예 리더 장교를 육성한다.

화학과는 화학 전 분야에 걸친 이론과 실험 교육을 통해 생도들로 하여금 자연현상을 이해시킴과 아울러 논리적 사고력과 문제 해결 능력을 배양시키고 과학적인 데이터 분석 방법과 의사결정 방법을 습득시킴을 교육목표로 하고 있다.따라서 생도들의 기초소양에 맞추어 일반화학 및 기초화학을 각각 개설하여 물질의 변화에 관한 기본 이론과 화학반응에 수반되는 에너지 변화 등 화학에 관한 기초적인 내용을 이론 및 실험을 통해 다루고 있으며, 특히 화생방관련 내용과 폭발물 등 군사적으로 응용되는 화학 분야를 소개함으로써 장차 군 장교로서 업무를 수행하는데 필요한 기본적화학지식을 배양시키고 있다. 또한 전공과정은 유기, 무기, 물리, 분석 및 생화학 등 화학 전 분야와 생리화학, 환경화학 및 군사화학 등 군사 응용 분야에 걸친 이론과 실습교육을 통해 생도들로 하여금 화학에 대한 전문지식을 습득시킴은 물론 장차 전문 직업군 장교로서 임무수행에 필요한 화생방 관련 지식을 함양시키고 있다.

이러한 교과 편성과 내용은 통신,화학,의무 등 특수 병과에만 국한되는 것이 아니라 유사시 국민의 생명과 재산을 보호하기 위해 모든 전문 직업군 장교에게 필수적으로 요구되는 능력을 부여하기 위한 것이다.

사관생도들이 자연현상에 대한 이해와 이를 적용하여 창의적이고 창조적인 응용을 할 수 있는 지식과 지혜를 습득할 수 있도록 물리화학과원 모두는 가장 가까이에서 도와주며, 더불어 전인격적인 교육을실시, 교수요원들은 모범을 보여 사관생도의 명예로운 정예 정규장교의 육성을 위하여 헌신한다.